Muestra gráfica de los resultados de mi trabajo en los últimos años relacionadas
con las granjas de ordenadores (PC-Farm) o grid. La primera que ensamblé
cuando esto era de verdad ir a la aventura fue la del
Protein NMRLab
en el CABM (abajo en la foto), hace 8 años lo que nos conviertió prácticamente en
pioneros en este campo y su aplicación a la
determinación de estructuras a partir de datos de RMN (restricciones de distancias).
PC-Farm del NMRLab en el CABM.
A la izquierda la vieja, 16 máquinas duales PIII-450 MHz.
A la derecha la nueva, 10 máquinas duales, Ahtlon 2000MP, con casi 1 año de
antigüedad y una capacidad endiablada. Obsérvese la disminución en el
tamaño de la unidades.
En la actualidad está casi obsoleta pero aún da
buenos resultados en la determinación estructural a partir de datos de RMN.
Como os comento más en profundidad en la sección de sistemas de colas,
comenzamos utilizando el DQS
como sistema pero el verano pasado las reconvertí
a PBS (aunque en realidad funcionan
los dos sistemas superpuestos).
También probé el CONDOR
pero para el cálculo estructural nos decidimos por el DQS más rápido y flexible
aunque menos robusto.
Por cierto, aquí ,
tenéis un buen enlace para seguir profundizando en granjas,
Beowulf, etc y encontrar enlaces a otros sitios
interesantes.
Imágenes de las granjas en el Departamento de
Química-Física de Universitat de València.
Primera granja que ensamblé en Valencia hace 3 años gracias a la financiación del
Proyecto PB98-1455 (Roberto Tejero, 1999-2002) y a la derecha la de
QuímicaFísica/ICMOL/IFIC con 56 CPU.