Página Personal de Roberto Tejero

Inicio

PdbStat

Water Ref

CASD-NMR

Manuales

Documentos

Galería

Programas

Enlaces

• CreateProc.
  Es un programa en shell (bash, aunque he probado versiones de c-shell y perl) que se encarga de repartir el trabajo de cálculo de estructuras en un entorno de granja de computación (grid).   Está preparado para el uso de DQS o PBS como gestores de colas y es adapatable al sistema final, incluso para una sola CPU.   Lleva incorporadas plantillas para el cálculo con programas como DYANA, CYANA y X-PLOR/CNS.
  
• PdbStat.
  Un programa para el análisis estructural de biopolímeros y otras aplicaciones de interés en RMN.
  
• HYPER.
  Un programa para la obtención de restricciones en el espacio de los ángulos diedros a partir de datos de RMN.
  
• GenCons
  Programa para la generación de restricciones.
  
• distnew, cambia .
  Programas para generar un conjunto de restricciones en función de la estructura conocida de un proteína homóloga. Con el conjunto de restricciones se puede aplicar simulated annealing (SA) con CONGEN para determinar la estructura de la proteína en función de la información estructural obtenida de la homóloga. En desuso al haberse incluído ambas opciones en PdbStat.
  
• get_viol, get_energy, get_dihe, run_auto_cgen, run_checknoes, make_all_pdb.
  Suite de C-shell scripts para el trabajo automático con CONGEN y el posterior análisis del conjunto de estructuras obtenidas (parcialmente adaptado para el caso de utilizar X-PLOR).
  
• idealized, omega, violnew
  Suite de programas escritos en FORTRAN y C para el análisis de estructuras utilizando CONGEN.
  
• ortocg, distocg
  Programas en FORTRAN para la conversión de datos de RMN formatos DISMAN, DIANA, DIANA-SYBYL a CONGEN. Conversión de coordenadas de ORIENT a CONGEN.
  
• WATER.
  Un programa para la eliminación de la señal del agua en RMN aplicando las transformadas de Hilbert. (En desuso).
  

Privado

Album

Albumes

Docencia 2014/15

Docencia 2013/14

Docencia 2012/13

Docencia 2011/12

Docencia 2009/10

Docencia 2008/09

Docencia 2007/08

Docencia 2006/07

Docencia 2005/06

Algunas estructuras

Amigos CABM

NMRLab at CABM